Cinq ans se sont écoulés depuis la destruction des Moissonneurs. Shepard a pris sa retraite et perdu le contact avec ses anciens coéquipiers. Elle reçoit le message d'un général qui lui demande de venir afin de parler d'un étrange signal émis depuis un lointain système. Que va t-elle découvrir? Ses amis sont-ils toujours vivants? Ce qui est sûr, c'est que l'histoire est sur le point de connaître un nouveau tournant...